Fedora zawiera serwery baz danych MySQL i PostgreSQL.
- MySQL
MySQL zostało zaktualizowane do wersji 5.1.31.
- PostgreSQL
Fedora 11 zawiera wersję 8.3.6 pakietu PostgreSQL. Wykonanie "dump/restore" nie jest wymagane z wersji 8.3.X. Mimo to zalecane jest ponowne zindeksowanie wszystkich indeksów GiST po aktualizacji.